ربط تناول الأم المصابة بالصرع باحتمال إصابة الجنين بالتشوهات الخلقية مقارنة بالأمهات الأخريات ويزداد هذا الاحتمال مع تناول الام لبعض أدوية الصرع
فمن أكثر أنواع التشوهات الخلقية التي لوحظت:
1. تشوهات القلب
2. تشوهات المسالك البولية
3. الصلب المشقوق
4. تشوهات الوجه والفم
5. تشوهات الهيكل العظمي
و يصاحب الاحتمال الأكبر لحدوث هذه التشوهات تناول دواء الڤالبروات (الديباكين) و الاحتمال اقل او لم يثبت حدوثه مع أدوية الصرع الأخرى
لا يعني هذا إيقاف ادوية الصرع عن الأم المصابة بالصرع اذ قد تحدث نوبات صرعية تهدد حياة الأم و الجنين و لكن تؤخذ الاحتياطات فيتم اختيار الأدوية الأقل خطرا و قد تحتاج الأم لتغيير الأدوية قبل حدوث الحمل و كذلك الاكتفاء بالعدد الأقل من الأدوية مادامت تسيطر على الحالة وتعطى الأم حمض الفوليك قبل وخلال الحمل بشكل متواصل